卷一百九十九 万历十六年六月
癸丑朔（初一）
- 原任吏部尚书严清上奏，感谢朝廷此前的慰问，皇上批复“知道了”。
- 命令按察使丘浙、知府杨沂、周良贵退休，参政应存卓、林偕春调任他职，起因是吏科给事中张鼎思弹劾他们不称职。
- 升任遵化守备朱士元为昌平游击。
甲寅（初二）
原任郧阳巡抚右佥都御史、现被逮捕审问的李材，上奏辩解御史苏瓒对他的弹劾，大致内容为：
臣担任云南金腾兵备时，虽已擒获岳凤，但缅贼仍肆虐边境，土夷猛养、蛮莫都反叛归附缅贼，常年成为边境祸患。臣认为，若这两个酋长不归顺，边境永无安宁之日，于是大量设置间谍，向他们申明祸福，令其诛杀缅贼以赎己罪。大朗长是缅贼的亲信，散夺是缅贼的官员，这两人作为间谍前来接受指令，随后缅贼果然派遣三万兵力驻守遮浪，前来报仇，猛养惶恐之下请求救援。臣命令游击刘天俸等领兵星夜赶赴会合剿敌，才有了遮浪之捷。刘天俸最初上报的战功数量近万，生擒五千人，恰逢臣被提拔为郧阳巡抚，由陈严之就近接管事务，臣因难以长期停留，未能等到战功等级核定便离任。一个月后，巡抚刘世曾核实情况属实，才将战功上报朝廷。相关官员的联合核查、巡抚的验证上奏，都是臣离任后的事。
臣在家中待罪时，突然接到邸报，得知按臣苏瓒弹劾臣欺骗蒙蔽，称土夷联合兵力击败缅贼的功劳不属于朝廷军队。但以夷制夷、听候我方调度，就等同于我方兵力。此前蛮莫反叛三年、猛养反叛三十年，如今突然为我方诛杀缅贼，若非臣的调度，谁能让他们如此？陈严之乘胜追击，收服安抚遮些儿等五十余处，都是这两个酋长归附后的余威所致。至于说“杀害虏人、夷商”，蛮江、漳地一带因战乱千里无人烟，且战事消息早已传开，夷商怎会送死到战场附近？
臣往年担任广东官职时，仅凭一道之力就斩杀海倭、山寇四千余人，最终因得罪权贵而闲置田园，如今臣仍有当年的志向。若臣甘愿蒙受冤屈而死，怎能不让边臣寒心、丧失任事的决心？
奏疏呈上后，皇上严厉斥责李材：奉旨被提讯，本应等候到案审问，怎敢擅自上奏辩解？将奏疏下发相关部门处理。
乙卯（初三）
- 赐予原任礼部尚书何维柏谥号“端恪”。
- 禁止为现任官员修建生祠，命令抚按官查访销毁已建生祠，并弹劾治罪相关人员，这是采纳科臣李汝相的奏请。
- 升任广西参政沈应为广西按察使，礼部郎中张志为湖广参政、分守荆西，广东副使徐应奎为广东参政、分守海北。
丁巳（初五）
- 吏部遵旨上奏，请求提拔钦命降级的官员：州判张鸣冈、左之宜、顾宪成、高维崧，均任命为常州等府推官。皇上同意。
- 升任归德知府谢裘为广东副使，彰德知府陈九仞为河南副使。
- 升任真定守备杨方亨为遵化游击。
戊午（初六）
都察院右佥都御史詹仰庇上奏：我朝臣子修身悟道，深合圣人真谛，如薛瑄、胡居仁、陈献章、王守仁已得以从祀孔庙；罗伦、罗洪先也因纯正的理学修养，分别获得“文恭”“文毅”的谥号，他们均身居六品清职，却蒙受朝廷的褒奖。除此之外，南京国子监祭酒蔡清，笃学著书，品行高洁、匡正风俗，早年识破宁王朱宸濠的叛逆图谋，多次推辞显要官职的提拔，朝中舆论推崇他为儒学宗师，其德行无愧于前代贤哲。请求为蔡清赐谥、从祀孔庙。
皇上下令礼部商议回复，后赐予蔡清谥号“文庄”，从祀孔庙之事另议。
己未（初七）
核查河道的科臣常居敬上奏：黄河故道恢复工程难度极大，应停止施工，由此引发了开挖訾家营支河的提议。
庚申（初八）
- 京师发生地震。
- 大学士申时行等上奏询问皇上起居，因朝会典礼长期荒废，皇上正在休养。
- 升任巡抚应天右副都御史佘立为南京大理寺卿。
- 升任湖广都司尹邦宪为郧阳参将。
- 山西道御史陈登云上奏，请求册立太子，并追究外戚郑承宪骄横的罪状，皇上未予批复。
壬戌（初十）
- 大学士王锡爵因三年考绩合格，获赐钞锭、羊酒，上奏谢恩，皇上批复“知道了”。
癸亥（十一）
- 蓟镇督抚张国彦等上奏：归附夷人干多罗忽，命令部夷扯落等人撑放筏板，潜入潘家口，杀死运粮士兵二人，夺走驮砖马匹三匹，随后被官兵擒获贼夷卜儿大等五人。失职官员熊世锦等人分别受到处罚。皇上同意所拟处置方案。
- 升任太常卿周继为都察院右副都御史，巡抚应天。
- 升任福建都司佥书黎国耀为湖广都司，掌管军政印信。
甲子（十二）
- 皇上下诏：近年来传旨派造的绸缎中，尚未解送的部分，浙江暂停织造，苏州减半织造，以抚恤灾民，这是采纳工部尚书石星的请求。
- 对王锡爵下谕：卿被选拔担任机密要职，忠心勤勉地辅佐朝政，如今考核期满，功绩卓著，加授太子太保，其余官职照旧，荫封一子入国子监读书，并赐予新衔诰命。
王锡爵上奏推辞，大致内容为：臣三年来空占职位、白拿俸禄，失职之罪难以尽数。姑且以当前时事为例，北方干旱、南方洪涝，军队哗变、百姓怨叹，黄河决堤、火灾频发，各地告警不断，臣何曾有过一条消除灾祸的计策？此时圣明君主正下罪己诏，首辅大臣屡次请求辞去恩赏，且近来百官奉谕修身反省，臣身为辅臣，理应与朝廷休戚与共。如今臣即便不能牺牲自身以救济饥民、分担忧患，至少也应惜福避灾、知止不殆。
然而在朝廷考核中，臣既免于贬黜，又蒙宫中使者颁赐赏赐，得以无功受禄。若在此时安然接受爵位，于君主忧虑之际蒙受恩宠，上天正发怒，怎会宽恕臣？朝野清议又怎会原谅臣？臣不仅担心自身败亡，更担心上辱国家、下损名器。因此反复研读圣谕，每一字都令臣汗颜，不敢不详尽陈述内心的愧疚，祈求皇上收回成命，以维护朝廷考核制度的严肃性，也让臣免受为官不称职的非议。
皇上赞赏他公正忠诚、辅佐得力，谕令其恭敬接受赏赐，不允许推辞。
乙丑（十三）
- 礼部上奏：钦天监称六月庚申夜京师发生地震，震波从东北向西南，连续震动两次。此前山东、狭西已相继上报地震，京师作为国家根本重地，又发生此类异象；况且当前麦子成熟却阴雨连旬，饥荒、瘟疫四处蔓延，停止征税、减免军饷、平价买粮、捐献赈济的奏疏不断呈上，内外官员更应加倍修身反省，以回应上天的警示。皇上批复“知道了”。
- 升任大理寺少卿李尚思为太常寺卿。
丁卯（十五）
- 升任大理寺右少卿李栋为大理寺左少卿，顺天府丞宋仕为大理寺右少卿。
- 升任龙安知府杨邦直为苑马寺少卿。
- 贵州道御史何出光因灾异频发，上奏提出修身反省的实际对策，谈及时政：一是训练乡兵以镇压叛乱，二是调离跋扈官员以瓦解党羽，三是奖赏归顺者以离间逆贼阴谋，四是挑选交易货物以巩固和谈成果，五是更换把总以禁止剥削士兵，六是暂缓工程修筑以要求实际成效。奏疏下发兵部。
己巳（十七）
- 升任光禄少卿郭东为顺天府府丞。
庚午（十八）
- 兵部商议回复：狭西总督郜光先、甘肃巡抚曹子登会同巡按御史徐大化上奏称，罕哈抄把等酋长声称要借兵给虏王，西行报仇击杀瓦刹，途经甘肃边地。夷狄相互残杀，对中国有利，若他们不靠近嘉峪关、无暗中窥探抢劫的行为、不在水塘放牧停留以惊扰百姓，本可置之不理；但夷情难以预测，所谓“严守我方边界、收回我方人畜”，无论是安抚赏赐还是抗拒堵截，都应长远谋划并迅速处置。现镇夷游击来保患病，请求以守备达云接替。皇上同意所拟方案。
辛未（十九）
- 皇上临朝。
- 起用原任少卿艾穆为光禄寺少卿。
壬申（二十）
- 兵部商议请求革除湖广总兵官职，并罢免武靖伯赵光远，皇上不允许。
癸酉（二十一）
- 核查河道的科臣常居敬进呈《修理河道图考》，皇上批复“知道了”，将图册与考证留存参考。
- 调山西副使张世烈为阳和兵备。
- 户部商议回复礼科给事中陆懋龙的奏请：各省官员提前一年征收额定的差役银两，原本是因公费不足暂时借用，却逐渐沿袭成惯例，百姓难以承受，应当申令禁止革除，以抚恤灾民。皇上同意。
甲戌（二十二）
- 朝廷对天下愿意担任教官的贡生进行考试，将结果移交吏部。
丙子（二十四）
- 升任狭西参议原一魁为山西副使、昌平兵备。
戊寅（二十六）
- 孝庄睿皇后忌辰，派遣靖远伯王学礼前往裕陵行礼。
- 升任武库司郎中李蕴为狭西参议。
己卯（二十七）
- 云南道御史方万策上奏征剿湖寇的策略：一是扼守要害之地，二是防备内奸接应，三是孤立贼党势力，四是防备邻省边界，五是禁止奸民接济贼寇，六是优待领兵将领。兵部商议后同意施行。
- 河南道御史梅国桢进言：修身反省的实际措施，关键在于安抚贫民、体恤疲惫士兵、消除内乱、杜绝外患、整顿武备、防止盗贼，言辞恳切关切。皇上同意并申令整饬。
- 应天巡抚佘立上奏湖寇已平定，皇上批复“知道了”。此前湖中盗贼令三吴地区戒严，是最为严重的盗贼警报，让当权者颇为担忧；但马山官兵刚集结，盗贼却突然消失，仅通过零星搜捕抓获几个首领便结案。因此御史彭而珩随后提出抽调吴淞游击部队进入湖区防守的提议，这也是善后的考虑。
庚辰（二十九）
- 孝穆皇后忌辰，派遣丰城侯李环前往茂陵行礼。
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