大明神宗显皇帝实录卷之三百六十六
万历二十九年十二月初一（甲子朔），朝鲜国王李昖奏报：对马岛倭寇请求通款讲和。此前，朝鲜人俞进得等人从日本逃脱返回，称倭酋平秀吉即将去世，命令家将德川家康统领东北三十三州，毛利辉元统领西南三十三州，辅佐年幼的儿子丰臣秀赖；倭将上杉景胜占据关东叛乱，德川家康率领全部兵力前往征讨，毛利辉元与小西行长等将领进入大坂城合兵抵抗，德川家康攻破大坂城，将小西行长等将领全部诛杀，日本国内大乱。对马岛主平义智及其将领平调信，将全部投降的朝鲜人送回，送信请求讲和，还假意声称德川家康将运送十八万石粮食作为军饷，以胁迫朝鲜。
朝鲜与对马岛隔海相望，对马岛土地多山，不产五谷，粮食依赖朝鲜供给，战争爆发后朝鲜停止开市，对马岛倭寇百般胁迫请求通款。平秀吉去世后，明朝军队全部撤回，朝鲜畏惧倭寇势力，暗中与倭寇通款已久，又担心因通倭得罪明朝，因此派遣陪臣前来请求指示。兵部进言：“倭寇与朝鲜通款之事难以断定，总督万世德熟悉倭寇情况，职责在于经略（筹划治理），应令其斟酌商议后奏报。”皇上准从。
工部尚书杨一魁回复御史高举条陈的河漕三策，进言说：“如今黄河利于向东流淌，不利于向南改道，这是众人皆知的道理。但全河已溃决，难以立即挽回，堵塞决堤的工程，绝非轻易之事。因此臣等此前的奏疏，主张从决堤处规划治理，如在傅家集、宋家庄等处开凿直河引导水流向东，同时疏浚李吉口以下到坚城集三十余里的泥沙淤积河道，全力开挖，再改挖唐家口引导水流进入龙沟、汇入小浮桥，以防全河水流返回后灌入镇口。之后堵塞黄堌口以约束水流，再堵塞新决堤口以阻挡洪水，这样主漕才能回归，旧河道才能恢复。否则下游不疏浚，即便上游堵塞，也会很快再次决堤，或此处堵塞、彼处决堤，终究无济于事。因此臣认为，开凿直河、堵塞黄堌口、疏浚淤塞河道，这是根本策略，是今日应紧急施行的；
泇河工程全靠山东的泉源供水，此前虽已疏浚，但未达到深广要求，且中途经过梁城、彭河、葛墟岭等处，山石坚硬，开凿困难，因此河口仅宽一丈六尺，水深也相同。如今回空的船只已能勉强通行，可见工程成果不应舍弃，似应大力疏浚，或根据地势，每十数里修建一座堤坝，中间设置木闸以蓄水泄洪，等待新漕运；韩庄渠道向上连接微山湖、吕孟湖之间的水域，需多方疏浚以防淤塞阻碍，使水流顺畅流入马家桥、夏镇，作为漕运的补充水源，这是一时的权宜之计，因此臣认为，疏浚泇河以完成工程、接济漕船，这是辅助策略，是今日应同时施行的；
至于开凿胶莱河（连接胶州湾与莱州湾的人工运河）一事，先臣刘应节曾开凿但中途停止，他所开的本是新河，一难在黄埠岭地势险峻，二难在马家濠岩石陡峭，三难在大小沽口水流湍急，因此开凿困难，最终无成效。如今台臣（御史）提议舍弃新河，恢复元朝时的旧河道，确实最为便利，但这条河道长四百余里，工程浩大，其中道路的险峻平坦、开凿的难易程度、费用的多少，以及河运与海运换船的事宜、借用班军的提议，都不是臣等能远程估算的，应行文各该河道大臣勘察斟酌，商议妥当后覆奏定夺。因此臣等认为，开凿胶莱河以恢复海运，防备河运中断，这是备用策略，应等待商议确定后再施行。
施行这三条策略，需分清轻重缓急、遵循先后次序，不滥施工程、追求实效，不朝令夕改、确保成功，臣认为当前治河的关键要务，没有比这更合适的了。”皇上圣旨：“着令治河官员抓紧疏浚旧河、堵塞决堤口，泇河已有工程基础，也着令疏浚以备使用；胶莱河着令山东抚按勘察核实后奏报。”
任命河南道御史高举为北直隶巡按，提督学政（掌管教育、科举）。
初二（乙丑），荫封左佥都御史夏良心的儿子夏警芳为国子生，这是因夏良心三年考满给予的恩赏。
宴请建州等卫进贡的夷人奴儿哈赤（努尔哈赤）等一百九十九人，由侯陈良弼负责接待。
初四（丁卯），原任礼部尚书兼翰林院学士朱赓上疏推辞入阁任职的命令，皇上颁布优诏催促其应召赴任。
在西市将皮林叛逆苗民吴国佐、石纂太凌迟处死，其余党羽被判决流放或处死的各有不同。
吴国佐是洪州司特洞寨的苗民，其始祖吴奋儿在洪武年间在沅州、靖州一带叛乱，被诛杀。吴国佐的叔父吴大荣，勇猛剽悍，豢养亡命之徒，因图谋不轨被处死。吴国佐性情凶暴狡猾，曾越过淮河前往泗水，通晓汉语，略懂文字。吴大荣死后，吴国佐收留其妾龙氏，黎平府官员逼迫紧急，吴国佐本就有反叛之心，上下皮林等寨的苗民彭举、尚马等人都推举服从他，于是发动叛乱，自称“天皇上将”，表面接受招抚，暗中观察播州酋首的胜负，持观望态度。
石纂太也自称“太保”，杀害百户黄钟音等一百余人，与吴国佐合兵围攻上黄堡。万历二十八年二月，参将黄冲霄、守备张守忠率军征讨，吴国佐探知明军虚实，命令吴之臣假装投降引诱明军，设下埋伏发动突袭，明军大败，黄冲霄逃往永从县，苗兵追击到城下，斩杀明军溃兵一千余人，溪水都被染红，活捉张守忠，将其活活烤死，强迫他自食其肉，张守忠骂不绝口，被苗兵凌迟分食。随后苗兵攻占水井、燕窝等七十余处屯堡，焚烧五开卫南城，攻破永从县，围攻中潮所。总兵陈良玭、陈璘率领贵州、湖广军队前来征讨，陈良玭的军队战败，退守靖州，吴国佐更加嚣张。
万历二十九年正月，巡抚江铎出镇靖州，命令陈璘率领副将李遇文等兵分七路进军围剿，陈璘的军队擒获苗党银贡等人，游击宋大斌攻破特洞各苗寨，苗民占据险要地形坚守不出，陈璘放火烧寨，苗民多被烧死，吴国佐逃往天浦四十八寨，后又逃入古州毛洞，被明军追击捕获；石纂太逃往广西上岩山，被指挥徐时达引诱擒获；杨永禄率领一万余名苗民驻守白冲，游击沈弘猷、董献策率军夹击，将其擒获，各苗寨全部平定。
初五（戊辰），大学士沈一贯进言：“今日文书官冉登恭捧圣谕到内阁，送来蓟州、永平、山海总兵官尤继先的四本启本（公文）。臣查看，前两本是启告皇太子的，原本称为‘启知’，与奏报皇上的题本、启本不同，无需烦劳批复。这是祖宗旧制，只希望皇太子熟悉政务、开阔眼界，预先了解事务而已，至于决断则是君父的职责，非皇太子所能干预。今后此类文书，皇上阅览后，似应直接赐予东宫留存查看，臣谨将启本封还，奏报皇上知晓。”
命侍读史继偕、编修陶望龄、杨继礼、检讨刘生中、李腾芳、沈＜氵隺＞掌管文官诰敕的撰写。
初六（己巳），太仆寺卿南企仲请求下令户部补还借用本寺的白银七百多万两，奏疏下发户部。
初七（庚午），户部因万历二十九年各边关未发放的年度军饷银共一百五十余万两，商议暂时借用宣府镇储存的白银三十余万两，转发给大同、山西，作为权宜借贷接济的费用。皇上圣旨：“边饷缺口大，地方又遭遇荒歉，应紧急筹措发放，以安抚军心。各省直拖欠的钱粮，准许权宜借贷兑拨，着令抓紧督促催缴起解，限定日期考核政绩。各该衙门务必同心协力，以军国大事为重，不得各自推诿，仍像以往那样懈怠。该部、科（给事中）要随时核查参劾，不得姑息。”
初八（辛未），命令恢复朵颜各夷人的马市、木市（交易马匹和木材的集市），同时恢复宁前（宁远、前屯卫一带）的木市。
起初，辽东马市准许海西及朵颜等三卫夷人交易，开原每月一次，广宁每月两次，这是成化十四年的制度。一百多年来，互通贸易的马匹、货物对明朝有利，且通过马市的税收即可支付对夷人的赏赐，贡夷（前来朝贡的夷人）还能侦察虏寇动静，即便有大规模入侵，明朝也能及时收兵防备，益处很多。
万历二十三年，小歹青想在义州大康堡开设木市，准许各夷人砍伐木材顺河运出交易，巡抚李化龙为此请求，也根据木材数量给予夷人抚赏，但与马市的报箭（核对身份的凭证）、旧例相比有所不同。万历二十六年，巡抚张思忠称，土蛮的儿子扯臣憨联合小歹青，每年既获得市赏，又要求比照宣大（宣府、大同）的赏赐标准，还时常抢掠，马市、木市因此商议停止。此后，虏寇大规模入侵或零星抢掠，每年都有发生，全辽都深受其苦，而各酋也多次前来请求开市。
小歹青、扯臣憨等都聚集在边境附近，愿意按照万历二十三年的抚赏标准，完全听从约束，总兵李成梁断定恢复集市有利，请求亲自负责此事；长昂、董狐狸、老丝孩子三位酋首也请求恢复宁前木市，总兵尤继先准许。蓟辽总督万世德将此事奏报朝廷，并进言说：“辽东的马市与其他各镇不同，其他各镇都是对朝贡的虏寇开放，抢掠的虏寇不允许入市，入市的虏寇不会抢掠，每年支出数万两白银，明确作为诱饵，夷人也贪图明朝的财物，不敢轻易动武。而辽东的马市、木市，只相当于其他各镇的民市，百姓因有利可图，因此即便虏寇有顺有逆，终究不与他们断绝集市。且虏情难以预测，即便在嘉靖、隆庆年间，哪一年不开市？哪一年没有大规模抢掠？不过是表面安抚、暗中修整战备罢了。怎能因往年虏寇或入市、或抢掠，担心他人议论，而不敢承担责任呢？天下事没有全利而无弊的，利多弊少就应施行。若有利无害却仍犹豫不决、观望不前，岂是臣子为边境安定谋划的态度？边疆利害关系重大，需像古代那样给予将领灵活处置的权力，不受朝廷遥控，也不受他人干预，才能顺利成事。恳请皇上颁布谕旨，告诫将领，使其能全力治理边疆，不辜负重任，这是臣等的最大愿望。”兵部按照万世德的建议覆请，皇上准从。
建州夷人奴儿哈赤（努尔哈赤）到边关通款讲和，北关夷人那林孛罗请求补进双份贡品。兵部进言：“二酋叩关请求进贡，与其他反叛的夷人不同，应一并准许。起初，南关夷人王台与北关逞加奴、仰加奴二夷人相互仇杀，王台死后，逞加奴、仰加奴的儿子卜寨、那林孛罗，杀死王台的孙子歹□，歹□的儿子年幼，遗留的部夷及一百三十七道敕书（朝廷授予夷人首领的凭证）归属其叔父猛骨孛罗。猛骨孛罗请求补进双份贡品，北关那林孛罗多次侵犯猛骨孛罗，猛骨孛罗无法抵抗，向奴儿哈赤求援，以子女作为人质。奴儿哈赤将猛骨孛罗诱骗到寨中，捏造罪名杀害。明朝派遣使者前往诘问，奴儿哈赤请求将自己的女儿嫁给猛骨孛罗的儿子吾儿忽答。
万历二十九年七月，奴儿哈赤到抚顺关外交涉，杀白马盟誓，安抚吾儿忽答，保护其部落，随后将女儿嫁给吾儿忽答；那林孛罗也归还原本掠夺的六十道敕书，请求像猛骨孛罗那样补进双份贡品。此前，南关、北关夷人相互仇杀，南关的残余夷人康古陆因与歹□有仇，联合猛骨孛罗反而帮助北关。奴儿哈赤杀死猛骨孛罗后，又将吾儿忽答囚禁，南关势力如风中残烛，南关灭亡后，奴儿哈赤又逐渐蚕食北关，最终吞并海西各夷人部落，奴儿哈赤从此更加强大，最终无法控制。”
吏科右给事中田大益上疏请求选拔任用河道大臣，进言说：“黄河为患已到极点，治河事务延误日久，请求立即将杨一魁罢官削职、勘察处置，严厉督促李颐星夜赴任。”皇帝没有批复。
初十（癸酉），礼科右给事中白瑜上疏提出四件事，户部尚书陈蕖回复其中四款：
一是“授予虚衔以疏通积压人才”，称所纳官员到任后不支领俸禄，考满后给予恩典、一体转升，这是冒滥行为；
二是“临时开复（恢复官职）以广泛选拔人才”，称让获罪的进士、举人缴纳赎金恢复官职，这是违背法令；
三是“追缴实际赃款以警戒贪污”，称各巡按在审问贪赃官吏时，按省份大小每年限定追缴赃银数额，导致急于凑数而混淆廉洁与贪污的界限；
四是“勘察税契（房产土地交易的契约征税）以惩治侵吞”，称按照田价每两征收三分税银，无论交易新旧一概征税，额外征税无法安定百姓。
奏疏呈上，皇帝没有批复。
十一日（甲戌），福建晋江、南安、惠安、同安、莆田、仙游等县遭遇灾害，按照灾害程度予以减免赋税、赈济百姓。
十三日（丙子），皇太子亲自前往妃府迎娶，婚礼完成。
三边总督李汶因平定洮岷（洮州、岷州）生番（未归附的番族）六忍、熟番（已归附的番族）力节的功劳，上疏请求为巡抚贾待问、总兵孙仁、兵备副使袁弘德等及参与其事的文武官员评定功劳等级，给予优厚叙赏。
十四日（丁丑），因皇太子婚礼完成，赐予辅臣茶饭。
宴请朵颜等卫进贡的夷人邦失等二百十七人，命侯陈良弼负责接待。
十五日（戊寅），大学士沈一贯因皇上召太医院官员进宫诊脉，呈递揭帖询问皇上的起居状况。
兵部进言：“整个套虏（河套地区的虏寇）请求通款讲和已久，宁夏镇至今未确定商议方案，请求催促商议，以便覆奏。”皇上圣旨：“准。”
十六日（己卯），礼部因皇太子婚礼完成，请求皇上升殿接受朝贺，皇上传旨免朝。
皇太子奉皇上命令，在文华门接受群臣朝贺，群臣行四拜礼。
皇上患病，召见辅臣，下令停止矿税，释放被逮捕关押的人员，补用科道官员，恢复建言获罪诸臣的官职。
当天巳时，皇上紧急召见辅臣及部院等官到仁德门，单独召辅臣沈一贯进入启祥宫后殿西暖阁。当时中宫皇后、翊坤宫妃嫔都在养病，未在身边侍奉，皇太后面向南站立，稍靠北位置；皇上穿戴冠服，在地上铺席而坐，稍靠东偏西南方向；皇太子、各位亲王环绕跪在面前。沈一贯叩头问安后，皇上说：“沈先生来了，朕病情很重，身体虚弱，在位时间也已长久，没什么遗憾了。佳儿佳妇，如今托付给先生，先生辅佐他做个好皇帝，有事情还要劝谏纠正他，让他讲学勤政。矿税之事，朕因三殿、两宫尚未建成，暂时采取的权宜之计，如今应传谕停止，各地的织造、烧造（烧制瓷器）也都停止；镇抚司及刑部此前关押的罪犯，都释放复职；因建言获罪的诸臣，都恢复原职；行取（从地方选拔京官）的科道官员，都准允补用。朕见先生这一面，就要舍弃先生而去了。”沈一贯高呼万岁称谢，进言说：“皇上圣寿无疆，怎能如此多虑？希望皇上宽心静养，自然会恢复安康。”说着不禁失声痛哭，皇太后、皇太子、各位亲王也都哭泣。皇上急忙起身上床，沈一贯又奏报：“六部尚书有三人请求辞职，希望皇上谕令他们留任处理事务。”皇上说：“兵部尚书田乐、户部尚书陈蕖，都令其立即出来供职；工部尚书杨一魁不堵塞黄堌口，冲犯朕的祖陵，着令革职为民。”沈一贯再次叩头退出，拟定圣旨，当晚在朝房值班住宿。
礼部等衙门、礼科等科联合奏报，询问皇上的病情。
二更时分，守宫官员将圣谕送到辅臣住所，谕旨内容与皇上当面所说一致，只在中间增加：“南京供应机房属于旧制，连同苏杭织造，内官有负责御用及婚礼袍服的，都着令照旧；已采集征收在官的金银等物品，及织完的绒匹、烧完的瓷器，还着令原派遣的内官押运进献；如有奸恶之徒拦截阻碍，及驿站供应延迟缓慢的，指名参劾处置。”几句。沈一贯回奏：“臣正询问众医皇上所患病症，他们都说绝无意外，不必过分担忧。况且今日明旨一下，造福天下的功绩无穷，普天之下万众同祝，天地神明暗中保佑，只需皇上耐心静养，安康的喜讯必定指日可待。所奉圣谕，臣立即传示各衙门，向天下公布，让众人共同祈祷皇上圣寿万年。原谕旨文本将恭敬收藏在内阁，载入信史，让世人知晓大圣人的作为远超寻常。”
十七日（庚辰），皇上派遣文书官到内阁，要收回此前的谕旨。大学士沈一贯题奏：“昨日恭奉圣谕，臣与各衙门官员都在朝房值班住宿，当时立即知晓，消息传播迅速，已传达施行。顷刻之间，天下都已知晓，要一一收回实在困难。已成的命令既已下达，反悔并非适宜之举，惟望皇上三思，以保全完美的德行与大业，增添长寿与福运，臣不胜忠诚爱戴之情。”
十九日（壬午），户部尚书陈蕖因河南巡抚曾如春为修筑汴堤，直接截留漕粮折银、赃罚银、事例银等，上疏争辩说：“河堤修筑事务隶属于工部，应由工部自行筹措经费，若其他部门的钱粮，必须行文协商后才能开支准许，没有直接截留的道理。漕粮折银、赃罚银、事例银等，是本部接济边饷的正额款项，如今内库极度匮乏，日夜催促仍担心延迟，眼下今年的年度军饷二百余万两无银可发，万一军饷无法供应，突然发生意外变故，谁来承担责任？查阅以往文书，没有因河工而直接截留边饷的先例，实在万万难以依从。”皇上圣旨：“你部称钱粮匮乏难以借支河工，但河工正紧急需要费用，工部立即设法筹措后奏报。”
总督两广都御史陈大科去世。陈大科是直隶通州人，隆庆五年进士，从河南推官做起，被召为给事中，累官至太常寺卿、右副都御史，巡抚广西，升任兵部右侍郎、总督两广，加授右都御史，到这时在家中去世，朝廷赐予祭葬全礼，追赠兵部尚书。
二十日（癸未），谕示内阁：“朕此前头晕目眩，召见卿当面谕示的事务，关于矿税等项，因两宫、三殿尚未建成，国库空虚，暂时采取的权宜措施，如今国家费用不足，难以停止，仍着令照旧施行，待三殿建成，该部题请后再停止。其余事务，卿再斟酌应当施行的，拟定圣旨呈奏。”大学士沈一贯回奏：“如今皇上身体刚康复，正应更加注重调养，承接上天的福泽，怎能因区区财物而妨碍休养？臣希望皇上暂且不要为这些事务费心，安心静养，保全自身与百姓，实为幸事。容臣三思后再奏报。其中事情无疑应施行的，如推补行取的科道官员、起用因建言获罪的诸臣、释放因矿税建言获罪的犯人，臣已拟定三道圣谕，惟望立即批准下发，预先慰藉朝廷内外的期盼。”皇上回复知晓，所拟定的圣谕中，仅行取科道官员的一道下发，其余未下发。
任命曹于汴、翁宪祥、萧近高、宋一韩、孙善继、钱梦皋、胡忻、李成已、钟兆斗为六科给事中，沈时来、方大镇、孔贞一、钱桓、余＜棥心＞衡、杨廷筠、刘九经、张攸渠、乔应甲、左宗郢、汤兆京、康丕扬、沈裕、王夔龙、温如璋、金忠士、李培、高攀枝、史学迁、沈正隆为各道御史；南京的科道官员为储纯臣、金士衡，道臣为孙居相、胡鹗、周＜棥心＞相、关扬、李云鹄、史弼。命令下达后，诸臣当天谢恩赴任，这是遵照“立即到任管事”的圣旨。
二十一日（甲申），乾清宫、坤宁宫动工兴建，辅臣沈一贯恭敬前往视察，皇上赐予茶饭，此后每月成为常例。
命礼部铸造河漕道的关防（官印）。
江西税监潘相的舍人（亲信）王四等人在饶州横行霸道，激起民变，导致器厂被烧毁，潘相诬告通判陈奇可不能捉拿救险。皇上圣旨：将陈奇可逮捕，陈奇可上疏自我辩白，皇帝没有批复。
二十二日（乙酉），原任大学士申时行、王锡爵因册立、册封及为圣母加尊号之事，分别呈递奏疏庆贺，皇上回复知晓。
孝陵奉祀、魏国公徐弘基的府邸被火烧毁，徐弘基具疏奏报，皇上怜悯，下令相关部门查看后奏报。
翰林院编修郭淐、刑部办事进士张九德因押送诏书延迟，各被剥夺四个月俸禄。
命礼部铸造龙江、瓦屑二关的抽分关防（征收商税的官印）。
二十四日（丁亥），吏部尚书李戴等联名上疏进言：“百姓听闻停止矿税，喜悦如同重获新生。当天午后，忽然隐约听闻皇上心意似乎有迟疑，众人都认为期盼多年，才换来皇上心意转变，未曾想不到一天又要改变。从此之后，百姓还有什么指望？臣等不敢议论民情政体，只就当前皇上身体安康、圣德完美的策略进言：昨日恩旨一颁布，随即听闻皇上身体清爽安康，一念之间带来吉庆，一句话如同甘霖，上天眷顾圣德，如同回声回应声音。既然因言论而感动上天，怎能在感动上天后又中途改变？谚语说‘分散（恩惠）则为福’，分散既是福，那么聚集（不施恩）就是灾。如今已明确昭示仁德，全部停止矿税，一人的恩泽遍及四海，四海的歌颂归于一人，以此为福，难道还能限量？皇上试想，昨日患病时，即便有如山的黄金，又怎能解救病痛的万分之一？财物的无用，也由此可见。从今以后，皇上身体日益安康，与天下人共享太平欢乐，拥有天下，难道还担心贫穷？臣等不敢再提其他建议，只希望皇上坚决施行此前的谕旨，几句话之间成就千古功业，收回四海民心，安享世间美名，长久保持完美的福运。臣等所说的皇上身体安康、圣德完美的万全之策，没有比这更重要的了。”皇上不听。
户部也上疏进言：“听闻矿税照旧施行，臣等不胜惊惧。如今天下臣民都以先前的圣旨为依据，必定不会认为有再次开采征税的道理；即便在外的内官，听闻停止矿税的命令后，必定已押运现银返回京城，怎能再返回地方照旧开采？各地百姓惊疑惶恐，各自依仗明旨，反而会酿成祸端。况且天子无戏言，无论前代还是祖宗以来，从未有圣旨已施行却又中途停止的情况。昔日孔子与子贡谈论政事，认为宁可舍弃粮食、舍弃军队，也不敢舍弃信用。如今矿税所进献的，无非是作为军饷、粮食的来源，怎能舍弃信用而加重百姓的困境？臣等甘愿承受鼎镬之刑，不敢遵奉此命。”
二十七日（庚寅），太仆寺卿南企仲上疏弹劾吏部尚书李戴、刑部尚书萧大亨：“如今内阁传达的圣谕已过数日，却未听闻吏部恢复哪位官员的官职，有人说已发交台省（御史台、六部）查访，有人说尚未确定商议方案。那些因建言获罪的诸臣，众人有目共睹，吏部职责在于识别人才，平日怎能没有定论？况且这项恩典，去年已有起用被埋没官员的诏书，为何过了一年仍不施行？李戴常对人说‘皇上不用建言诸臣，我有什么办法’，却在去年冬天拜受诏书、今年春天奉谕后，仍如此犹豫不决。知晓有贤才却不任用，是旷废职责；奉命却不执行，是蒙蔽贤才，有这两条，臣认为李戴应当罢官。
刑部关押的囚犯，最伤天地和气，一旦施行宽政，无异于让他们重获新生，而萧大亨却仿佛没有听闻。臣在途中遇到他的下属，询问缘由，下属说‘是为诸臣讨取保结’，圣谕何曾有‘保结’的说法？更奇怪的是，萧大亨的奏疏中称‘应释放的释放’，可曾释放过一人？已经奉旨却不遵行，甘愿拖延观望；未释放却声称释放，实在是欺君罔上，有这两条，臣认为萧大亨应当罢官。
推究二臣的意图，莫非是援引矿税之事，效仿户部伏地请求，以此自我解脱？矿税的两道谕旨稍有不同，但从未听闻再次命令杨一魁（此前谕令杨一魁革职），同样是圣谕，杨一魁的命令施行不到一天，李戴、萧大亨却将其视为常规旧事，臣实在无法为二臣辩解。”奏疏呈上，皇上谕示内阁：“南企仲不以君父为重，专门收买人心、施恩于人，新老因建言获罪、被降革的诸臣，都不准恢复官职。因矿税牵连的人犯，刑部、镇抚司仍牢固监禁，不许纵容。南企仲本当重治，姑且降一级调用，不许含糊推升。李戴、萧大亨奉公守法，立即出来处理事务，不许再上奏烦扰。”
大学士沈一贯回奏：“捧读圣谕，其中处置各项事务，以及慰留李戴、萧大亨，更见皇上思虑周全、精神充沛，臣不胜喜悦欣慰。皇上身体刚康复，以休养为重，一切外事都应搁置，臣会传示二臣，令他们立即出来供职，不要上奏烦扰，以免劳累皇上。皇上也应澄清思虑、摒弃杂念，顺应自然，不再将琐事放在心上，以迎接无穷的福运。那些因建言获罪的诸臣、因矿税牵连的人犯，皇上心中已加以怜悯，恩旨必定会适时颁布。恩泽出自朝廷，实在不是臣下所应私自施予的，惟望皇上以天地为心，以宽广为德，不要因臣下的烦言而长久搁置已有的仁德之意，为天下人赐福赦罪，也就是为皇上增添福运、消除灾祸。臣不胜恳切期盼。”
南京户部尚书张孟男因衰老患病请求辞职，皇上不允许。
益王朱翊鈏请求为内使王奉等十人授予冠带，礼部按惯例奏报，皇上准允。
二十八日（辛卯），皇上再次谕示内阁：“朝廷开征矿税等项，因两宫、三殿尚未建成，国库空虚，是暂时采取的权宜措施，昨日已有谕旨，只是传闻尚未确定。卿可传示该部院，立即行文给各处钦差内官及抚按等官，都着令照旧遵行，待三殿建成，题请后再停止。如有违抗阻碍的，一体治罪。”
大学士沈一贯进言：“所奉圣谕，臣应当传达施行，但臣受皇上大恩，一旦有差错，后悔莫及，因此冒昧仔细筹划、深入考虑，以等待皇上裁决。皇上既然说停止矿税有期限，何必多颁布谕旨？这道谕旨若传达下去，不仅不能禁止人们烦扰，反而会招来更多烦扰。皇上聪明如神，对此或许偶然没有深思。恩旨颁布后，部院怎能完全遵奉行文给各抚按？臣知他们必定会执意上奏争辩；那些抚按官又怎能完全遵奉而无后续议论？臣又知他们必定会执意上奏争辩；科道及南北两京十三省的官员，又怎能默默无声？臣又知他们必定会执意上奏争辩。如此一来，臣正劝皇上静养，反而导致皇上增添烦忧，臣怎能忍心？臣又有何罪可逃？人们既已烦扰，皇上也必定会收到众多弹劾臣的奏疏，臣无法再侍奉皇上一天了。昨日吏部、刑部只因请求命令未得到答复，弹劾的奏疏已随之而来，皇上虽有明谕，他们仍都闭门不出，二臣尚且如此，臣的处境可想而知。臣若遭受一次弹劾，绝无苟且留存的道理，此时恐怕会让皇上动气，花费精力处置，臣不足惜，只是恐怕不是国家之福。因此反复思考，不敢轻易传达，以免因众人的议论而干扰皇上的静养。惟望皇上再加斟酌，慎重发布诏令，臣自知无能，不称职任，谨伏在草席上等待治罪，请旨裁决。”
临淮知县林錝被广东采珠太监的随从赵安诬告，称赵安经过临淮时，林錝不供应夫役，撕裂勘合（官方文书）、抢夺银两，皇上严厉下旨将林錝逮捕。到这时，林錝被捆绑押解起程，凤阳巡抚李三才上疏为其辩冤，林錝也自我辩白，皇上均未批复。
二十九日（壬辰），吏部尚书李戴奏言：“因建言获罪的诸臣，都是一时的贤才，人们都盼望陛下收录任用已久。不久前陛下慷慨下达明谕，臣立即核查他们的职名，正准备上疏奏报，却因矿税之事未决断，先前的谕旨被收回。陛下身体正在静养，各类奏疏都无法呈上，臣心急如焚却无可奈何。转眼之间，错失良机，即便臣自己也深感懊悔。南企仲为国家着想的心意，胜过臣一筹，臣十分佩服他的直言。陛下有这样的美意，臣却不能顺势将恩泽传遍天下，臣的罪过实在万死难辞。臣的病已很重，正处在生命将尽之时，一是因不能劝谏君主，导致官员职位空缺过半，应当离职；二是如今又不能推广陛下的德意，辜负天下人的期望，应当离职；三是古人说‘大臣以正道侍奉君主，行不通就辞职’，臣不能引导君主走正道，又不能辞职，怎能还厚着脸皮位居百官之上呢？”
刑部尚书萧大亨奏言：“自从矿税征收以来，案件株连蔓延，牵连无辜，臣身为刑部官员，亲眼目睹这些苦难，内心的怜悯之情，不在南企仲之下。只是臣遵奉敕谕，分条列出事项奏报，南企仲或许不清楚其中的细节罢了。如今监狱中，只有湖广生员沈希孟等一起人、原任御史曹学程一人，其余的要么已定罪发配，要么已革职回籍，并不在狱中；若有尚未送审的，又由镇抚司监禁等候处置，与臣部无关。敕谕中没有指名释放的人员，臣自然不敢擅自决定。于是行文各部门，查明诸臣的姓名及获罪应释放的缘由，一边奏报，一边释放，起初没想到已下达的命令会立刻收回，奏疏送到会极门，却被坚决拒收。此事出于意外，实在难以预先预料。南企仲督促责备臣，臣也能理解，他见陛下的恩泽已开始施布却又受阻，百姓将要获得生路却又陷入困境，于是指责臣执行不力，因此没来得及考虑事情存在诸多阻碍。臣希望陛下罢免臣的官职，仍将因矿税牵连的人犯及建言诸臣特别予以宽释，臣即便退居乡野，也会感到无比荣耀。”
二人各得圣旨：“已有特别谕旨，部院事务繁多，卿等应遵奉谕旨立即出来供职，不得再陈请辞官，以免增添烦扰。”
户部尚书陈蕖等人因皇上反悔停止矿税之事，详细陈述六条不可行的理由，皇上不听。
三十日（癸巳），户部回复巡仓御史严一鹏关于漕运政务的五件事：
一是“明确浅滩管辖以避免推诿”：桃花浅到王家摆渡浅，归属钞关主事管辖；里二泗浅到中心楼浅，归属通粮郎中管辖，议事文书中规定得十分明确。但从王家摆渡浅到里二泗浅，是最容易搁浅阻滞船只的河段，这是钞关与通粮郎中管辖的交界处，双方常常互相推诿。此处的合站浅，应专门归属通粮郎中管辖，驳船（转运搁浅船只粮食的小船）的运费及管辖区域，沿用旧例已久，难以另行商议。只需行文管河司官，严格督促差役，将王家摆渡等浅滩疏浚至足够深广，若有懈怠玩忽、导致河道堵塞的，立即参劾追究。
二是“补足剥船以保障转运”：河西务额定设置剥船八百只，归属开关主事管辖；石土二坝设置剥船二百七十只，归属通粮郎中管辖。如今剥船有的因破损维修、有的被私自挪用、有的数量缺失，导致起剥转运延迟。提议从今年开始，每年春季初，对所有剥船进行查验，破损的及时修理，务必补足原额数量，不许剥船驶出管辖区域。
三是“调整过闸顺序以加快漕运”：议事文书中规定，黄河河道宽阔，允许超越船队过闸；闸河（设有水闸的运河段）则不允许。近来昌密地区的边粮漕船，无论是否在闸河段，都擅自超越，而被超越的仅限南粮漕船。经查，山东、河南每年的漕粮，有派拨总海船（大型海船）运输的，山东、中都地区都有总浅船（浅水区专用船）。海船船体沉重难以牵引，浅船虽行驶便捷，但按惯例不敢抢先，导致延误时日，最终因冰冻滞留。拟行文巡漕御史，允许浅船超越海船，先抵达通州，将粮食盘运至泓船（大型运输船）后，泓船再前往交纳；海船到达后，泓船再返回接运。若有延误的，听凭漕运司官捉拿追究，并将此规定补充进议事文书。
四是“规范运官交接以杜绝懈怠”：议事文书中规定，把总等运官必须等粮食全部交完后才准许交接离任，这是既定惯例。如今有的运官不等接替人员到任、粮食未入仓就离任赴新职，依法应当严惩，以警示后人。同时咨文总漕衙门，申饬十三把总（漕运武官），务必遵守议事文书的规定，违者参劾追究。
五是“明确漕储道职责以协同治河”：漕储道专门为漕粮事务设立，职责专一，疏浚河道、调配剥船、押运催缴等，各有分管；霸州、密云的兵备道，也负有河道管理职责。提议漕储道大臣在粮船全部进入闸河后，先前往天津，会同户、工部大臣及霸州、密云兵备道大臣，同心料理河道事务。
皇上命依照所议执行。
命锦衣卫指挥使李桢国为北镇抚司理刑官，原理刑都指挥佥事周嘉庆升任都指挥使，仍一同管理理刑事务。
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